引用本文:
【打印本页】   【下载PDF全文】   查看/发表评论  【EndNote】   【RefMan】   【BibTex】
←前一篇|后一篇→ 过刊浏览    高级检索
本文已被:浏览 3847次   下载 2420 本文二维码信息
码上扫一扫!
分享到: 微信 更多
miR-4472的靶基因预测及生物信息学分析
刘珏1, 陈星光, 朱雯, 侯秋英, 张旭, 沈方方, 滕懿群
嘉兴市第二医院儿科、嘉兴市儿童医学中心
摘要:
目的应用生物信息学分析方法预测miR-4472的靶基因及信号通路。方法利用miRBase数据库分析miR-4472的物种保守性;利用Targetscan、miRDB数据库进行靶基因预测,再用DAVID数据库将miR-4472的预测靶基因集合进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析。结果miR-4472预测的交集靶基因共378个。GO分析结果显示,miR-4472的靶基因主要参与转录的正负调节、细胞凋亡、蛋白质磷酸化等生物过程(均P<0.01)。KEGG信号通路分析结果显示,miR-4472的靶基因显著富集于PI3K-Akt信号通路、胰高血糖素相关信号通路、心肌细胞中的肾上腺素能信号传导通路、醛固酮的合成和分泌相关信号通路(均P<0.05)。结论miR-4472靶基因富集的信号通路均与新生儿缺氧缺血性脑病密切相关,尤其是P13K/AKt信号通路。
关键词:  
DOI:10.12056/j.issn.1006-2785.2020.42.13.2019-3553
分类号:
基金项目:浙江省自然科学基金一般项目(LY18H040014);浙江省科技计划项目(2013C33218)
Abstract:
Key words: