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| 目的应用生物信息学分析探讨吲哚胺N-甲基转移酶（INMT）在肝癌发生、发展中的作用及可能的机制，为肝癌的防治提供生物信息学依据。方法本研究从TCGA下载肝癌RNA测序数据库及患者临床资料，包含371例肝癌患者的癌组织以及50例肝癌患者的癌旁组织；GSE102079肝癌基因芯片数据从GEO下载，芯片共包含152例肝癌患者的癌组织和91例肝癌患者的癌旁组织。采用R语言分析INMT在TCGA和GSE102079中肝癌组织和癌旁组织的表达差异以及与预后的相关性；分析两个数据库中INMT相关基因的蛋白相互作用网络，对重叠基因进行GO和KEGG通路富集分析，采用STRING数据库构建INMT的相关基因互作蛋白网络。结果和癌旁组织相比较，INMT基因在肝癌组织中显著低表达（P＜0.01）。与INMT低表达肝癌患者相比较，INMT高表达肝癌患者总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）显著延长（P＜0.01）。TCGA和GSE102079肝癌数据库中INMT的相关基因共有178个重叠，主要涉及PI3K-AKT信号通路、细胞黏附分子、肿瘤信号通路、细胞黏附、血管形成等生物过程。构建INMT相关基因的蛋白相互作用网络，发现COL14A1、FBLN1/2、PECAM1、EMCN、FLT4等在INMT相关基因的蛋白相互作用网络中发挥关键作用，为进一步探讨INMT在肝癌中发挥作用的下游机制研究提供生物信息学依据。结论INMT可能在肝癌中发挥抑癌基因的作用，与肝癌的预后较好显著相关。 |
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| DOI：10.12056/j.issn.1006-2785.2021.43.1.2020-4171 |
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| 基金项目:国家自然科学基金（81802733）；广东省自然科学基金（2018A030313730） |
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