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| 目的通过人类癌症基因组图谱（TCGA）数据库筛选乳腺癌中关键的增强子RNA（eRNA），探讨其与乳腺癌患者预后的相关性。方法下载组织特异性增强子来源的长链非编码RNA（lncRNA）及其调控基因的列表，并下载TCGA数据库中相关的RNA测序数据和临床数据。通过生物信息学分析筛选与预后相关的eRNA，筛选标准为与肿瘤的总体存活率（Kaplan–Meier对数秩检验，P＜0.05）和调控基因（相关系数r＞0.4，P＜0.001）具有显著相关性。结果与乳腺癌总体存活率相关性最强的eRNA是AP003059.2，基因共表达分析显示包括苹果酸酶3（ME3）在内13个基因的表达与AP003059.2显著相关，AP003059.2可能通过影响这些基因的表达，从而在乳腺癌发生中发挥作用。结论AP003059.2可能是乳腺癌中关键的eRNA，并且与乳腺癌的预后显著相关。【关键词】AP003059.2长链非编码RNA增强子乳腺癌苹果酸酶3 |
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| DOI：10.12056/j.issn.1006-2785.2021.43.15.2021-1280 |
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| 基金项目:浙江省自然科学基金项目（LY18H160042）；浙江省中医药科技计划项目（2021ZA014）；浙江省医药卫生科技计划项目（2019KY278） |
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