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基于生物信息学分析E74样转录因子3在卵巢浆液性囊腺癌中的表达及作用机制
崔涵1, 张春雷, 刘文珍
中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院第一派驻门诊部
摘要:
目的采用生物信息学方法探讨E74样转录因子3(ELF3)mRNA在卵巢浆液性囊腺癌中的表达水平,及其对卵巢浆液性囊腺癌的诊断、预后评估价值,并分析其可能的作用机制。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中获取2006至2021年内收录的379例卵巢浆液性囊腺癌组织样本和88例正常卵巢组织样本的临床信息以及ELF3mRNA表达数据分析其表达差异,获取基因表达综合数据库(GEO)GSE38666数据集中12例正常卵巢上皮细胞及18例卵巢浆液性囊腺癌上皮细胞的测序结果进行ELF3mRNA表达水平验证。比较卵巢浆液性囊腺癌组织与正常卵巢组织、卵巢浆液性囊腺癌上皮细胞与正常卵巢上皮细胞ELF3表达情况;比较不同临床病理特征患者卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3mRNA表达水平;分析ELF3mRNA表达水平对卵巢浆液性囊腺癌的诊断价值;比较ELF3mRNA高表达与低表达患者预后;富集分析ELF3在卵巢浆液性囊腺癌中可能参与的信号通路。结果卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3mRNA表达水平高于正常卵巢组织(P<0.05)。卵巢浆液性囊腺癌上皮细胞ELF3mRNA表达水平高于正常卵巢上皮细胞(P<0.05)。不同国际妇产科协会(FIGO)等级、初始治疗效果、种族、组织学分级、肿瘤发生部位、血管侵犯、肿瘤残留的患者卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3mRNA表达水平比较差异均无统计学意义(均P>0.05),年龄>60岁的患者卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3mRNA表达水平低于年龄≤60岁的患者(P<0.05)。ELF3mRNA表达水平诊断卵巢浆液性囊腺癌的ROC曲线显示AUC为0.988,最佳截断值为4.450,灵敏度为0.988,特异度为0.977。ELF3mRNA低表达患者总生存期和疾病特异性生存期均优于高表达患者(均P<0.05)。ELF3mRNA表达相关的基因可能参与G蛋白偶联受体(GPCR)配体结合和神经元系统两条信号通路。结论ELF3mRNA表达水平在卵巢浆液性囊腺癌中具有较高的诊断、预后评估价值,高表达患者预后较差,并可能通过GPCR配体结合和神经元系统两条信号通路发挥作用。
关键词:  
DOI:10.12056/j.issn.1006-2785.2022.44.13.2021-3132
分类号:
基金项目:中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院院内科研计划项目(2021yxky057)
Abstract:
Key words: