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目的利用生物信息学和机器学习策略,初步探索特应性皮炎(AD)差异表达基因(DEGs)及其与免疫细胞浸润的关系,以提高对该疾病的认识和诊治水平。方法从基因表达谱数据库(GEO)中检索了两个基因表达数据集,分别包括20名健康志愿者的正常皮肤和51例未经治疗的AD患者病损皮肤进行建模,以及22名健康志愿者的正常皮肤和30例AD病损皮肤用于验证,以确定DEGs。使用最小绝对收缩和选择算法回归模型和支持向量机-递归特征消除对DEGs进行了验证。通过CIBERSORT来评估AD的炎症状态,进一步探讨DEGs与免疫细胞之间的相关性。结果与健康志愿者比较,AD患者中MAPKAPK5反义RNA1(MAPKAPK5-AS1)的表达有差异。此外,AD与健康志愿者之间皮肤的6种免疫细胞比例也存在显著差异。同时MAPKAPK5-AS1的表达水平与初始B细胞、活化的CD4+记忆T细胞和活化的肥大细胞的数量之间均呈正相关。结论MAPKAPK5-AS1可能是AD的一个重要的DEGs,并且与免疫细胞浸润特征存在关联,为AD的诊断和治疗提供了新的思路。 |
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DOI:10.12056/j.issn.1006-2785.2024.46.18.2023-1799 |
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