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铁死亡相关基因表达与结直肠癌患者预后的关系
程国雄1, 陈正伟
丽水市人民医院胃肠外科
摘要:
目的探寻结直肠癌(CRC)患者铁死亡相关基因的差异表达情况,分析这些基因的表达与患者预后的关系。方法从基因表达谱数据库中选取CRC差异表达基因数据集GSE32323、GSE21510和GSE934及铁死亡相关基因集为研究对象,筛选CRC患者差异表达的铁死亡相关基因,并对筛选的共差异表达基因进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络构建、基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,估算免疫细胞浸润与基因表达水平的相关性。根据共差异表达基因表达水平分为高、低表达组,比较两组患者总生存率和无病生存率。回顾性分析2018年1月至2023年12月丽水市人民医院手术切除的44例CRC组织石蜡切片,采用免疫组化染色检测患者癌组织中共差异表达基因蛋白表达水平,并分析其与患者临床病理特征的关系。结果4个数据集中有共差异表达基因3个,分别为MYC、电压依赖阴离子通道蛋白3(VDAC3)基因和缺氧诱导脂滴相关基因(HILPDA)。PPI分析显示,3个蛋白共有蛋白节点33个,节点间相互作用219种,平均聚类指数为0.68。GO功能和KEGG信号通路富集分析显示,3个基因功能主要富集于转录调控、DNA模板、核质及转录因子结合;信号通路主要富集于癌症、细胞周期和铁死亡。VDAC3基因高表达组患者无进展生存率和总生存率均显著高于低表达组(均P<0.05),而MYC、HIL-PDA高、低表达组患者总生存率和无病生存率比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。结肠癌患者中,VDAC3表达水平与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞和中性粒细胞浸润有关(均P<0.05);直肠癌患者中,则与CD8+T细胞、CD4+T细胞浸润有关(均P<0.05)。免疫组化显示VDAC3主要在细胞质中阳性表达。44例CRC患者VDAC3阳性表达20例(45.5%),VDAC3阳性表达组和阴性表达组患者肿瘤分化程度、血管侵犯比较,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论MYC、VDAC3基因和HILPDA为CRC患者差异表达的铁死亡相关基因,VDAC3低表达与CRC患者预后不良有关。
关键词:  
DOI:10.12056/j.issn.1006-2785.2024.46.14.2023-2710
分类号:
基金项目:丽水市科技计划项目(2020SJZC037)
Abstract:
Key words: