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基于MALDI-TOFMS结合随机森林算法建立碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌分类检测模型
许晓波 高芸涛1
浙江省荣军医院检验科
摘要:
目的基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOFMS)鉴定数据,用随机森林算法建立碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CR-KP)的快速分类检测模型。方法回顾性收集2022年6月至2023年12月浙江省荣军医院检测到的非重复肺炎克雷伯菌240株,同时收集了经MALDI-TOFMS鉴定且成功率90%以上的质谱峰图。根据药敏检测结果分为CR-KP 80株、碳青霉烯敏感肺炎克雷伯菌(CS-KP)160株。用K-means对质谱数据进行聚类并确定“质心”分类峰作为特征,构建随机森林分类模型,数据的70%作为训练集,30%作为测试集。分别用测试集分数、十倍交叉验证和ROC曲线评估模型的检测效能。结果构建的随机森林分类模型在测试集上的分数为0.94,十倍交叉验证分数为0.84,AUC为0.986(95%CI:0.950~1.000),特异度为0.980(95%CI:0.938~1.000),灵敏度为0.905(95%CI:0.814~0.995)。CR-KP和CS-KP质谱峰图的最大差异特征峰为4519m/z。结论基于MALDI-TOFMS构建随机森林分类模型对识别CR-KP有较高的效能,可以为临床早期干预及抗生素的合理使用提供依据。
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