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基于生物信息学分析探索基底 细胞癌中铁死亡相关基因
黄芳畅 朱鑫 严军 梁兴龙1
茂名市人民医院皮肤科
摘要:
目的 通过生物信息学分析探索基底细胞癌(BCC)中差异表达的铁死亡相关基因(DE-FRGs)。 方法 在基因表 达综合数据库中筛选目标基因芯片 GSE7553,并从 FerrDb 数据库下载铁死亡相关基因(FRGs)数据集。利用 GEO2R 分析识别 GSE7553 数据集中的差异表达基因(DEGs)。通过韦恩图分析得出 DE-FRGs。对 DE-FRGs 进行基因本体论和京都基因与基因 组百科全书(KEGG)富集分析,并利用基因/蛋白质相互作用检索工具分析基因的蛋白交互作用。使用 Cytoscape 软件构建蛋白 质-蛋白质相互作用网络,最后利用cytoHubba插件筛选核心基因。 结果 共筛选出51个参与BCC发生与进展的DE-FRGs,其 在细胞对化学应激、氧化应激和金属离子反应中显著富集。KEGG 分析显示 DE-FRGs 主要涉及癌症中的微小 RNA 和转录失调、 铁死亡等方面。通过 cytoHubba 插件最终确定 4 个核心基因:CD44、雄激素受体、锌指 E- box 装订同源盒 1 和溶质载体家族 11 成员 2。 结论 本研究通过生物信息学分析初步鉴定出 4 个 DE-FRGs,可作为 BCC 的诊断标志物和治疗靶点,为未来进一步研 究BCC的诊断与治疗提供新的方向。
关键词:  
DOI:
分类号:
基金项目:茂名市科技计划立项项目(2024074)
Abstract:
Key words: