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GIMAP7在肺腺癌组织中的表达及其临床意义的生物信息学研究
李安安1, 吴佳富, 牟泠葳, 张继琛, 王斌梁, 郑森中, 陈巍
台州市第一人民医院心胸外科
摘要:
目的探讨免疫相关蛋白GTP酶7(GIMAP7)蛋白在肺腺癌组织中的表达情况及其临床意义。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载539例肺腺癌患者GIMAP7转录组数据及相关临床资料,根据GIMAP7表达水平分为高表达组270例和低表达组269例,比较两组患者总生存期、无进展间隔期。回顾性收集2021年6月至2022年6月在台州市第一人民医院行手术治疗并经病理检查确诊为肺腺癌20例患者的手术组织标本进行免疫组化染色,验证其GIMAP7表达水平。利用TIMER和ESTIMATES算法分析GIMAP7表达水平与免疫细胞浸润的关系,单基因富集分析(ssGSEA)法分析GIMAP7相关的信号通路。结果TCGA数据库转录组学分析显示GIMAP7在肺腺癌组织中呈低表达(P<0.05)。GIMAP7低表达组患者总生存期、无进展间隔期均短于高表达组(P<0.001、0.013)。20例肺腺癌组织样本免疫组化结果表明85.00%(17/20)的患者GIMAP7在肺腺癌组织中呈低表达。GIMAP7的表达水平与CD4+T细胞、CD8+T细胞、B细胞、树突状细胞、巨噬细胞、中性核细胞丰度及ESTIMATES评分均相关(均P<0.001)。ssGSEA结果显示,GIMAP7主要参与适应性免疫、白细胞介导的免疫反应和淋巴细胞介导的免疫、核小体组装等通路。结论GIMAP7在肺腺癌中呈显著低表达,GIMAP7的表达水平与免疫细胞浸润相关,其有望成为肺腺癌免疫治疗的新型生物标志物。
关键词:  
DOI:10.12056/j.issn.1006-2785.2024.46.13.2024-252
分类号:
基金项目:台州市社会发展科技计划项目(21ywa47)
Abstract:
Key words: