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| 目的基于成簇规律间隔短回文重复序列（CRISPR）文库数据，分析和预测雌激素受体（ER）阳性乳腺癌新型治疗靶点。方法检索CRISPR文库测序数据、表达谱芯片数据，比较不同组ER阳性乳腺癌细胞与他莫昔芬耐药相关的缺失靶基因和差异基因；对测序数据、表达谱芯片数据取交集；使用STRING数据库分析潜在他莫昔芬耐药基因的蛋白互作网络（PPI）；使用注释、可视化和综合发现数据库注释基因功能和信号通路；使用基因集富集分析（GSEA）软件分析核心基因集；对3个核心基因集和潜在他莫昔芬耐药基因取交集；使用基因表达谱交互式分析数据库绘制生存曲线。采用qRT-PCR和免疫组化实验测定ER阳性乳腺癌患者的跨膜糖蛋白（BSG）表达水平。结果CRISPR文库测序数据、芯片表达谱数据结合分析，筛出61个潜在他莫昔芬耐药基因；PPI分析发现，其中的30个基因间存在显著相互作用；30个基因与3个GSEA核心基因集的交集分析发现，BSG是唯一基因。生存分析显示BSG高表达与ER阳性乳腺癌患者较短的无病生存期显著相关（P＜0.05）。qRT-PCR、免疫组化实验结果证实BSG在ER阳性乳腺癌患者中呈显著高表达。结论基于CRISPR文库预测BSG是ER阳性乳腺癌患者新型治疗靶点，结合生物功能实验和临床特征可更好验证预测结果。 |
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| DOI：10.12056/j.issn.1006-2785.2024.46.19.2024-498 |
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| 基金项目:广东省医学科学技术研究基金资助项目（A2021178） |
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