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丝氨酸蛋白酶抑制剂F1与膀胱癌 免疫治疗相关性的生物信息学 研究
袁红科 陈超 吕辰涛 毛鑫鸿 孙刚1
杭州市余杭区第三人民医院泌尿外科
摘要:
目的 基于生物信息学探讨丝氨酸蛋白酶抑制剂F1(SERPINF1)与膀胱癌(BCa)免疫治疗的相关性。 方法 利用癌 症基因组图谱等数据库对 SERPINF1的转录组数据、临床数据和突变数据进行综合分析,评估SERPINF1表达水平与BCa患者临床病 理特征及预后、免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷(TMB)、肿瘤免疫功能障碍及排斥(TIDE)的关系,并分析潜在功能。 结果 不同临床分 期、T分期、N分期、组织学分级患者SERPINF1表达水平比较,差异均有统计学意义(均P<0.01)。SERPINF1高表达组患者5年生存 率明显低于低表达组(37.3%比49.3%,P=0.020)。京都基因与基因组百科全书通路富集分析和基因集富集分析均显示,SERPINF1 富集于磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路。SERPINF1高表达组BCa样本免疫评分、基质评分和ESTIMATE评分均高于低表达 组(均P<0.01);BCa样本中的初始B细胞、M2型巨噬细胞和静息肥大细胞比例均高于低表达组(均P<0.05),而滤泡辅助性T细胞、 静息自然杀伤细胞、活化的肥大细胞、嗜酸性粒细胞、活化的树突状细胞比例均低于低表达组(均P<0.05)。SERPINF1高、低表达组 TMB评分比较,差异无统计学意义(P=0.076)。SERPINF1高表达组TIDE评分明显高于低表达组(P<0.001)。抗程序性死亡配体-1 (PD-L1)无应答组SERPINF1表达水平明显高于抗PD-L1应答组(P=0.027)。 结论 SERPINF1可作为BCa免疫治疗效果的潜在 预测因子。
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