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纳米孔测序技术辅助二代测序 技 术 确 认 新 等 位 基 因 HLADRB1*12:101
陈男英 董丽娜 何亿镇 陈晨 李奇 朱发明1
浙江省血液中心输血医学研究所
摘要:
目的 鉴定人类白细胞抗原(HLA)新等位基因 HLA-DRB1,并分析其核苷酸序列。 方法 基于 Ion Torrent S5 平 台二代测序技术(NGS)检测 HLA 基因分型,并利用基于纳米孔测序技术平台的三代测序技术(TGS)进行确认。 结果 样本经 NGS检测,结果为 HLA-A*02:01, 11:01;-B*15:02, 40:01;-C*08:01, 14:02;-DRB1*12:XX, 15:01;-DRB3*03:01;-DRB5*01: 01;-DQA1*01:02, 06:01;-DQB1*03:01, 06:02;-DPA1*01:03, 02:02;-DPB1*05:01:01G, 21:01:01G。其中HLA-DRB1*12:XX存 在碱基突变,TGS检测确认结果一致;它与HLA-DRB1*12:02:01:01比,第6外显子788位碱基G>A,导致234位编码氨基酸由甘氨酸 变为谷氨酸。新等位基因序列已提交至GenBank数据库(编号为OP459299),并于2022年10月31日被世界卫生组织HLA因子命 名委员会正式命名为HLA-DRB1*12:101。 结论 应用纳米孔测序技术辅助NGS成功确认了HLA-DRB1新等位基因,扩展了已知 的HLA等位基因库,对HLA基因精准分型具有重要意义。
关键词:  
DOI:
分类号:
基金项目:浙江省自然科学基金资助项目(LTGY24H080007);浙江省医药卫生科学研究基金资助项目(2023KY658)
Abstract:
Key words: