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胶质母细胞瘤脂质代谢相关基因的生物信息学分析
王立康 姜旭东 张思楠等1,2,3
1.佳木斯大学临床医学院;2.大庆油田总医院检验科;3.大庆市中医医院检验科
摘要:
目的 利用生物信息学方法鉴定与胶质母细胞瘤(GBM)相关的脂质代谢基因。 方法 从基因表达数据库(GEO)获 取GSE68848数据集,筛选差异表达基因(DEGs),然后与脂质代谢相关基因交叉。采用基因本体论及京都基因和基因组百科全书分 析研究脂质代谢相关DEGs的功能。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络进一步确定中枢基因。基因表达谱交互式分析数据库进行验 证。基因富集分析用于分析关键中枢基因显著富集的信号通路。肿瘤免疫估计资源数据库评估关键中枢基因表达与免疫细胞浸润之 间的相关性。通过“reshape2”软件包和ESTIMATE评分法分析关键中枢基因与免疫检查点、基质评分、免疫评分和ESTIMATE评分 之间的相关性。 结果 148个脂质代谢相关DEGs中有两个被鉴定为关键中枢基因。富集分析表明,脂质代谢相关DEGs显著调节 各种脂质代谢过程。通过MCODE和MCC算法分别鉴定1个关键模块和10个关键中枢基因。CYP27A1、HSD3B7被鉴定为关键中 枢基因,并且均与GBM不良预后相关。免疫分析表明,CYP27A1、HSD3B7与多种免疫细胞、多种免疫检查点、基质评分、免疫评分和 ESTIMATE评分相关。 结论 CYP27A1、HSD3B7被鉴定为可能参与GBM的关键脂质代谢相关基因,为探索GBM的发病机制和潜 在治疗靶点提供了新的见解和视角。
关键词:  
DOI:
分类号:
基金项目:黑龙江省中医药管理局中医药科研课题项目(ZHY2025-158)
Abstract:
Key words: